Tymovirales

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Tymovirales

Narzissen-Mosaikvirus (NMV),
Gattung Potexvirus

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Riboviria[2]
Reich: Orthornavirae[1]
Phylum: Kitrinoviricota[1]
Klasse: Alsuviricetes[1]
Ordnung: Tymovirales
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA linear
Baltimore: Gruppe 4
Symmetrie: helikal, ikosaedrisch
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Tymovirales
Links

Die Ordnung Tymovirales ist ein Taxon (Verwandtschaftsgruppe) von Viren mit einzelsträngigem RNA-Genom in positiv-Strang-Orientierung, das linear und nicht segmentiert ist. Ihre Vertreter sind überwiegend Pflanzenviren. Der Name für Ordnung ist von der Virusfamilie Tymoviridae und diese wiederum von ihrer Typspezies, dem Turnip yellow mosaic virus abgeleitet.

Schemazeichnung eines Partikel­fragments der Gat­tung Capillo­virus, Fam. Beta­flexi­viridae
Schemazeichnung eines Partikel­fragments der Gat­tung Capillo­virus, Fam. Beta­flexi­viridae
Schemazeichnung eines Partikels der Fam. Tymo­viridae
Schemazeichnung eines Partikels der Fam. Tymo­viridae
Genomkarte des Gelbe-Rüben-Mosaikvirus (TYMV)

Während die Virusteilchen (Virionen) der Vertreter der Familie Tymoviridae aus isometrischen, ikosaedrischen Kapsiden bestehen, findet man bei den anderen drei Familien filamentöse, helikale Kapsidsymmetrien. Aufgrund von Sequenzähnlichkeiten und ähnlichen Replikationsstrategien ist jedoch ein gemeinsamer evolutionärer Vorläufer für alle vier Familien anzunehmen, weshalb 2011 vom ICTV die neue Ordnung Tymovirales geschaffen wurde.

Innere Systematik

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Nach der offiziellen Virus-Taxonomie des ICTV, Stand Mitte April 2024, umfasst die Ordnung Tymovirales folgende Familien:[3][4]

EM-Aufnahme von ASPV-Virionen. Balken 100 nm
  • Spezies Apple stem pitting virus (ASPV, ehem. Typus)
  • Spezies Banana virus X
EM-Aufnahme von ASGV-Virionen. Balken 100 nm
  • Spezies Apple stem grooving virus (ASGV, ehem. Typus)
EM-Aufnahme von CLBV-Virionen. Balken 200 nm
  • Spezies Citrus leaf blotch virus (CLBV, ehem. Typus)
EM-Aufnahme von ACLSV-Virionen. Balken 100 nm
  • Spezies Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV, ehem. Typus)
EM-Aufnahme von GVA-Virionen. Balken 100 nm
  • Spezies Cherry mottle leaf virus (CMLV)
  • Spezies Grapevine virus A (GVA, ehem. Typus)
  • Spezies Grapevine virus B (GVB)
  • Spezies Sclerotinia deltaflexivirus 1 (ehem. Typus)
  • Spezies Marafivirus syrahense
  • Grapevine Syrah Virus 1 (GSyV-1)[18]
  • ohne Gattungszuweisung
  • Spezies Bombyx mori latent virus
  • Spezies Poinsettia mosaic virus

Äußere Systematik

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Koonin et al haben 2015 die Tymovirales taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[19] Der Stammbaum dieser Supergruppe ist nach den Autoren wie folgt:[20]


 „Alphavirus-like superfamily“  


 „Tetraviridae“ (vom ICTV 2011 aufgeteilt) 

Alphatetraviridae,[21] (mit Helicoverpa armigera stunt virus)


   

Carmotetraviridae[22] (mit Providence virus)


   

Permutotetraviridae[23] (mit Thosea asigna virus)


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?Birnaviridae (dsRNA)



   





Virgaviridae


   

Closteroviridae



   

Bromoviridae



   

Tymovirales (Ordnung)



   

Endornaviridae[24] (dsRNA, mit Oryza sativa alphaendornavirus)



   

Hepeviridae


   

Togaviridae (mit Alphavirus)


   

?Matonaviridae (mit Rötelnvirus — vom ICTV 2019 aus den Togaviridae ausgegliedert)


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?Nodaviridae[25] (mit Boolarravirus)



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Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch – wie die Birnaviridae – doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

ICTV Master Species List #35

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Mit der neuen Master species List des ICTV, ratifiziert im März 2020, ergibt sich abweichend folgendes Bild:[1]

 Orthornavirae  
 Kitrinoviricota 
 Alsuviricetes 
 Tymovirales 

Alphaflexiviridae (mit Lolavirus, Potexvirus)


   

Betaflexiviridae (mit Carlavirus)


   

Gammaflexiviridae


   

Deltaflexiviridae


   

Tymoviridae (mit Gelbe-Rüben-Mosaikvirus)


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 Hepelivirales 

Alphatetraviridae (mit Helicoverpa armigera stunt virus)


   

Benyviridae


   

Hepeviridae


   

Matonaviridae (mit Rötelnvirus)


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 Martellivirales 

Bromoviridae


   

Closteroviridae


   

Endornaviridae (dsRNA, mit Oryza sativa alphaendornavirus)


   

Kitaviridae


   

Mayoviridae


   

Togaviridae (mit Alphavirus)


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FlasuviricetesAmarilloviralesFlaviviridae


 Magsaviricetes – 
Nodamuvirales 

Nodaviridae (mit Boolarravirus)


   

Sinhaliviridae



 Tolucaviricetes – 
Tolivirales 

Carmotetraviridae (mit Providence virus)


   

Luteoviridae[26] (mit Blattrollvirus, Wasserrübenvergilbungsvirus und Gelbverzwergungsviren)


   

Tombusviridae


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 Orthornavirae
ohne Zuordnung 

Birnaviridae (dsRNA)


   

Permutotetraviridae (mit Thosea asigna virus)




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Von den Kitrinoviricota sind nur die Klassen mit den bereits genannten Familien gelistet, zwei weitere dieser Familien bleiben mit diesem Stand innerhalb der Orthornavirae noch ohne Zuordnung. Die „Alphavirus-like superfamily“ deckt sich im Wesentlichen mit dem Phylum Kitrinoviricota.

Als mögliches weiteres Mitglied dieses Phylums könnte eine vorgeschlagene Familie um das „Chronische Bienenlähmungsvirus“ (CBPV) infrage kommen, wenn die Nodaviridae und die Tombusviridae dessen nächste Verwandte sind, die Unterschiede aber eine eigene Familie rechtfertigen (siehe dort).

  • A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (eds.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012, ISBN 978-0-12-384684-6, S. 901ff

Einzelnachweise

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  1. a b c d ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ICTV Master Species List 2018b v1 MSL #34, Feb. 2019
  3. ICTV: Taxonomy Browser.
  4. ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  5. SIB: Alphaflexiviridae, auf: ViralZone.
  6. SIB: Allexivirus, auf: ViralZone.
  7. S. Majumder, M. Arya, R. P. Pant, V. K. Baranwal: Shallot virus X in Indian shallot, a new virus report for India, in: New Disease Reports (2007) 15, 52, ISSN 2044-0588
  8. SIB: Potexvirus, auf: ViralZone.
  9. SIB: Betaflexiviridae, auf: ViralZone.
  10. SIB: Carlavirus, auf: ViralZone.
  11. SIB: Foveavirus, auf: ViralZone.
  12. SIB: Capillovirus, auf: ViralZone.
  13. SIB: Trichovirus, auf: ViralZone.
  14. SIB: Vitivirus, auf: ViralZone.
  15. SIB: Gammaflexiviridae, auf: ViralZone.
  16. SIB: Deltaflexiviridae, auf: ViralZone.
  17. SIB: Tymoviridae, auf: ViralZone.
  18. Grapevine Red Blotch Disease (GRBaV). University of California, Agriculture and Natural Reserves. UCCE Sonoma county. Dazu:
  19. In älteren Arbeiten findet sich (mit abweichender Phylogenie) auch die Bezeichnung ‚Sindbis-like supergroup‘, Sindbis-Virus ist eine Spezies in der Gattung Alphavirus, Familie Togaviridae. Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
  20. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity, in: Virology Mai 2015; 479–480. 2–25. PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806.
  21. SIB: Alphatetraviridae, auf: ViralZone
  22. SIB: Carmotetraviridae, auf: ViralZone
  23. SIB: Permutotetraviridae, auf: ViralZone
  24. SIB: Endornaviridae, auf: ViralZone
  25. SIB: Nodaviridae, auf: ViralZone
  26. ICTV: ICTV Taxonomy history: Alfalfa enamovirus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)